Хотя ставропольский «Буревестник» выступал в республиканских соревнованиях в 1980-е годы, первый в Ставрополе профессиональный клуб был основан под названием «Виктор» в 1992 году.

С 1997 года выступает в Суперлиге. Сезон-1999/00 стал самым успешным для клуба на тот момент: очень уверенно выступая на втором этапе, команда заранее обеспечила себе итоговое 7-е место. Этот успех, однако, оказался локальным, в дальнейшем команда, как правило, боролась за право остаться в суперлиге, занимая в основном места в нижней части таблицы. Достаточно успешной стала середина 2000-х годов. После того, как в сезоне-2005/06 «Виктор-СКА» едва не покинул суперлигу, сохранив место в ней только за счёт удачного выступления в переходном турнире, команда попала в первую восьмёрку в следующем сезоне и в итоге заняла 7-е место. На команду сильно повлиял экономический кризис 2008–2009 годов: ещё в сезоне-2007/08 она боролась за попадание в еврокубки, а следующий сезон-2008/09 начался очень неудачно для команды, первая победа была одержана только в 7-м туре. По ходу сезона даже обсуждался вопрос о снятии «Динамо-Виктора» с чемпионата, но затем клуб немного выправил положение и до завершающего этапа чемпионата имел шансы на попадание в восьмёрку и плей-офф, но в итоге остался на 9-м месте. В 2008 году край выделил команде 11 миллионов рублей, а в 2009 — всего 620 тысяч, многие ведущие игроки ушли из команды. Во время зимнего перерыва сезона-2009/10 «Динамо-Виктор» даже не проводил тренировочных сборов, кроме того часть гандболистов была призвана в армию, что также отрицательно сказалось на силе команды.

Своих наивысших успехов ставропольский клуб добился в последние три сезона. Трижды подряд «Динамо-Виктор» занимал 4 место в Суперлиге. В сезоне 2017/18 домашней ареной для «Динамо-Виктор» стал СТЦ «Лукоморье», который был открыт в Буденновске. В этом сезоне ставропольский клуб впервые добился права выступать в еврокубках. В сезонах 2017/18, 2018/19 «Динамо-Виктор» принимал участие в Кубке вызова ЕГФ.

Команда Ставрополя является родоначальником развития в России пляжного гандбола, двенадцатикратным Чемпионом РФ, базовой командой для формирования национальной сборной команды России, ставшей Чемпионом Европы, призером Чемпионата Мира, Всемирных Игр по неолимпийским видам спорта.